Google+ Followers

viernes, 26 de noviembre de 2010

Flu virus animation

Hepatitis C Virus

Hepatitis C - Morbimortalidad

Uno de nuestros temas de predilección, la infección con virus de hepatitis C, sigue mostrando importancia en el mundo clínico, recientemente se publicó en España que La mitad de españoles con VIH tiene también hepatitis C y la coinfección incrementa la mortalidad un 14,2%.

http://www.europapress.es/sociedad/salud/noticia-mitad-espanoles-vih-tiene-tambien-hepatitis-20101125130056.html

Evoución de la Microscopía

Manuel nos socializa la existencia de un microscopio para ver moléculas una a una: http://curiosidadesdelamicrobiologia.blogspot.com/2010/11/un-microscopio-para-ver-moleculas-una.html


En breve, dice él que Sanjeevi Sivasankar es un profesor de Física y Astronomía de la Iowa State University que quería estudiar proteínas, pero de manera singular. No quería estudiar una disolución o un cristal que contiene millones de moléculas de proteínas en estado puro. No, él quiere estudiar las proteínas una a una.
Se trata, por tanto, de la combinación de dos tecnologías que permiten ese tipo de estudios: la microscopia de fuerza atómica y la transferencia de energía de resonancia.

El autor, cuenta Manuel, dice que usar una u otra de las tecnologías era como tener manos pero no ojos, o tener ojos pero no manos y por tanto de ahí su idea de combinarlas. El nuevo instrumento está siendo probado mediante el estudio de las cadherinas, un tipo de proteína que se encuentra en las membranas celulares de nuestras células y que sirve para que estás se mantengan juntas. También se está utilizando en el estudio del DNA y de los nanocristales.

Referencia original: Iowa State University, esta entrada participa en el XIII Carnaval de la Física

sábado, 22 de mayo de 2010

Genoma

Check out this SlideShare Presentation:
Genoma
View more presentations from HIJA.

lunes, 8 de febrero de 2010

Expression Strategies of Ambisense Viruses

Among the negative RNA viruses, ambisense RNA viruses occupy a distinct niche. Ambisense viruses contain at least one ambisense RNA segment, i.e. an RNA that is in part of positive and in part of negative polarity. Because of this unique gene organization, one might expect ambisense RNA viruses to borrow expression strategies from both positive and negative RNA viruses. However, they have little in common with positive RNA viruses, but possess many features of negative RNA viruses. Transcription and/or replication of their RNAs appear generally to be coupled to translation. Such coupling might be important to ensure temporal control of gene expression, allowing the two genes of an ambisense RNA segment to be differently regulated. Ambisense viruses can infect one host asymptomatically and in certain cases, they can lethally infect two hosts of a different kingdom. A possible model to explain the differential behavior of a given virus in different hosts could be that perturbation of the translation machinery would lead to differences in the severity of symptoms.

The ambisense coding strategy is an unusual way of encoding genes that presumably allows the virus to temporally control expression of the viral proteins, in particular if coupling of translation to transcription enhances the level of vc-encoded versus v-encoded protein expression. In any event, translation itself and/or translational control appear to play an important role in regulation of gene expression of ambisense viruses. Ambisense viruses have two hosts in which they can replicate. In their vector or reservoir host, infection is usually asymptomatic. However, in another host, multiplication of the virus can be lethal. Replication/transcription experiments in different host cell types would be helpful to shed further light on the differences observed in different hosts. At present, there are many complementary ways to study ambisense virus replication/ transcription such as cell culture, in vitro assays and reverse genetics systems. Since ambisense viruses are the meeting point of different viral families and are able to replicate in different hosts whether plants or animals and have different behaviors depending on the host, it would be particularly important to better understand the complex replicative cycle of ambisense viruses, in order to find the means to alleviate the lethal aspects of these pathogens.

Expression strategies of ambisense viruses. Virus Research 93: 141-150, 2003. doi: 10.1016/S0168-1702(03)00094-7

Taken by: AJCann, Expression strategies of ambisense viruses, (on line) url: http://www.microbiologybytes.com/blog/2010/02/08/expression-strategies-of-ambisense-viruses/?utm_source=feedburner&utm_medium=feed&utm_campaign=Feed%3A+Microbiologybytes+%28MicrobiologyBytes%29 (cited on) Feb 8/2010

miércoles, 3 de febrero de 2010

QUE RELACION EXISTE ENTRE EL CONSUMO DE TABACO Y LA MICROBIOLOGIA

Cuenta Manuel Sanchez, en su Blog "Curiosidades de la MicrobiologIa", que un grupo investigador de la Universidad de Maryland, dirigido por la Dra. Amy Sapkota, se ha puesto a estudiar la fauna microbiologica, o microbiota, presente en los cigarrillos.
Todo el mundo sabe que los fumadores son mas propensos a padecer infecciones respiratorias porque el tabaco debilita las defensas inmunitarias, ademas de otros efectos perniciosos.

Sin embargo, Dra. Sapkota se le ocurrio pensar que los cigarrillos tambien podrian ser una fuente de infeccion, a partir de los microorganismos presentes en ellos.

Cuando se intenta aislar microorganismos de un cigarrillo, mediante el metodo tradicional de conseguir aislamientos en placas de Petri, encuentra una o dos especies de estos. Pero el grupo de Sapkota ha utilizado una aproximacion basada en la genomica: Aislo y secuencio el gen del 16S rRNA de los microorganismos presentes en marcas tan conocidas como Marlboro, Camel o Lucky Strike. Alli encontraron grandes cantidades de bacterias pertenecientes a los generos Campylobacter, que puede causar intoxicaciones alimentarias y el sindrome de Guillain-Barre; Clostridium, que tambien causa intoxicaciones y pneumonias; Corynebacterium, tambien asociada a pneumonias; Escherichia coli, Klebsiella y Pseudomonas, patogenos oportunistas que pueden causar pneumonias, y una gran cantidad de especies de Staphylococcus.

Se podria pensar que el calor generado en la combustion de un cigarrillo seria suficiente para eliminar a las bacterias presentes en el mismo, pero puede que no. La combustion esta en una zona localizada y la aspiracion del humo podria desprender a los microorganismos y transportarlos al interior de los pulmones. Es precisamente este el siguiente objetivo del grupo de la Dra. Sapkota: Demostrar que eso puede suceder.

En conclusion, dejar de fumar es una accion benefica tanto para los pulmones como para el sistema inmune.

lunes, 25 de enero de 2010

*********** The Science of Small Clinical Trials ***********

The Office of Rare Diseases Research at the US National Institutes of Health (NIH), and the Office of Orphan Products Development at the US Food and Drug Administration (FDA), are pleased to announce the 2010 edition of their collaboratively developed course, "The Science of Small Clinical Trials." This is a broad survey course (not a high-level statistical seminar), which is intended to heighten awareness of the methods that exist to design and analyze clinical trials using small numbers of participants. An inescapable necessity when dealing with rare diseases, the use of small trials is also rising in prominence in the context of tissue transplantation, advanced prosthetics, and individualized pharmacogenomics.

The first edition of the course, offered in 2009, was restricted to FDA and NIH staff. The 2010 edition of the course has been revised (based upon comments from 2009 participants), and is now open to ANYONE who wishes to register. The course comprises 7 2-hour lectures, presented at the Lister Hill Center Auditorium on the NIH campus in Bethesda, MD, rom 16 February through 8 March, 2010; the lectures will also be available online via the Internet, live and by delayed on-demand video streaming (using freely available RealPlayer software), allowing anyone with a good Internet connection and appropriate computer to participate (questions from remote attendees will be received via a live text chat room, or via a discussion forum, on a web site dedicated to the course).

ALL participants must register. An optional self-administered open-book, On-line examination will be provided at the end of the course, and individuals who pass this examination will receive a certificate from FDA's Office of Orphan Products Development.

For more information about the course, and online registration, visit: ttp://small-trials.keenminds.org/

R.P.C. Rodgers, MD (CAPT,USPHS)
Office of Orphan Products Development,
FDA 5600 Fishers Lane(HF-35)
Rockville MD 20859
301-827-0142 (Phone)
301-827-0017 (Fax)

Stephen C. Groft, Pharm. D.
Director, Office of Rare Diseases Research,
NIH 6100 Executive Boulevard,
Room 3A-07 Bethesda,
MD 20892-7518
301-435-6041 (Phone)
301-480-9655 (Fax)

Individuals with disabilities who need Sign Language Interpreters and/or reasonable accommodation to participate in this event should contact Chris Griffin, ORDR, (301) 496-0266 and/or the Federal Relay, (1-800-877-8339).

Requests should be made at least 5 days in advance of the event.
**********************************************************************

---
ABOUT  TDR
The Special Programme for Research and Training in Tropical Diseases (TDR) is a global programme of scientific collaboration established in 1975, sponsored by the United Nations Children's Fund, United Nations Development Programme, World Bank and World Health Organization (WHO), and administered by WHO in Geneva, Switzerland. Its focus is on working with institutions in low and middle income countries on research into neglected diseases of the poor, with the goal of improving existing approaches and developing new ways to prevent, diagnose, treat and control these diseases.

For more information, visit: http://www.who.int/tdr

To share news with the TDR community, mailto:tdr-scientists@who.int

--
JC Teacher

lunes, 18 de enero de 2010

Microbiologia, tejidos y organos humanos.

Pellejos y Microbiota

Circunsicion de un adulto hallada en las paredes de las tumbas de Ankhmahor, Sakkara (Saqqarah), Egipto. Es la ilustracion mas antigua sobre la circuncision (Fuente: Wikipedia)

El ultimo numero de la revista PLoS ONE publica un curioso articulo titulado: Los efectos de la circuncision en el microbioma del pene. La razon del estudio es la siguiente observacion. Desde hace tiempo se sabe que los hombres circuncidados eran menos susceptibles a la infeccion por VIH o por herpesvirus sexual. En algunos casos el porcentaje de reduccion en infecciones alcanzaba el 40 por ciento. No solo eso, tambien se habia comprobado que las mujeres que mantenian relaciones sexuales con hombres circuncidados sufrian menos vaginosis bacterianas que aquellas que las mantenian con hombres sin circuncidar. ¿Por que sucedia esto?


Antes y despues de la intervencion

Los investigadores han abordado el problema de la siguiente forma. Tomaron muestras de la microbiota del pene de 12 hombres ugandeses negativos para el VIH, antes y despues de someterse a la circuncision. La microbiota fue caracterizada secuenciando el 16S rRNA de los microorganismos presentes. Han encontrado 42 familias bacterianas siendo las mas abundantes la Pseudomonadaceae y la Oxalobacteriaceae, sin importar si el hombre estaba circunciso o no.
Pero si encontraron diferencias en otras familias bacterianas. Los hombres circuncidados presentaban una disminucion en los microorganismos anaerobios. En concreto la Familia XI de los Clostridiales y la Prevotellaceae eran mucho mas abundantes en la microbiota presente antes de la circuncision. Dentro de dichas familias han encontrado generos que incluyen patogenos conocidos por ser causantes de vaginosis bacteriana, como Anaerococcus spp., Finegoldia spp., Peptoniphilus spp., y Prevotella spp. La circuncision elimina el habitat anoxico de dichos microrganismos causando la disminucion en su numero y explicando el menor numero de vaginosis bacterianas en mujeres que mantienen relaciones con dichos hombres.

Patogenos oportunistas presentes en la microbiota del pene sin circuncidar. Las microfotografias no estan a la misma escala. (Fuentes: Prevotella, Anaerococcus, Finegoldia)

Representacion de la abundancia de las familias bacterianas presentes antes (columnas a la derecha) y despues (columnas a la izquierda) de la circuncisi?o en los 12 hombres utilizados en el estudio. Notese que los colores entre las muestras son mas parecidos entre si tras la circuncision. Dicha homogenidad indica que las microbiotas son mas parecidas y que hay una perdida de biodiversidad de la microbiota despues de la intervencion. (Fuente: Price et al. PLoS ONE)

El mecanismo biologico que explicaria la proteccion frente al VIH parece ser multifactorial. Desde el punto de vista anatomico, la superficie interna del prepucio esta muy ligeramente queratinizada y presenta una gran abundancia de celulas de Langerhans, un tipo de celula del sistema inmune especializada en la defensa inespecifica y con capacidad de presentacion de antigeno a los linfocitos CD4. Las celulas de Langerhans son susceptibles de ser infectadas por el VIH y a partir de ellas transmitirse a los linfocitos CD4. En el aspecto microbiologico, las condiciones anoxicas de dicha superficie interna crean un ambiente ideal para el crecimiento de bacterias anaerobias que causan inflamacion de las mucosas y la activacion de las celulas de Langerhans. Al eliminar el prepucio se disminuye el numero de celulas de Langerhans, se queratiniza la zona y se altera la microbiota disminuyendo el numero de microorganismos anaerobios con efectos pro-inflamatorios.

Las celulas de Langerhans en la mucosa del epitelio son probablemente las primeras celulas atacadas por el VIH durante la transmision sexual. Las celulas de Langerhans expresan una lectina de tipo-C denominada Langerina que se une a los viriones del VIH y los conduce hacia el interior formando los granulos de Birbeck. Muchos de los viriones son degradados rapidamente, pero si una fraccion de virus consigue eludir a la degradacion entonces pueden comenzar a replicarse dentro de la celula de Langerhans y desde alli ser transmitidos a los linfocitos T CD4. (Fuente: Nature Medicine)

No es de extrañar que la OMS recomiende la circuncision como una estrategia protectiva, pero hay que tener en cuenta que no es una simple operacion quirurgica, pues en muchas culturas el aspecto del pene tiene un determinado simbolismo. Asi que este descubrimiento puede servir para diseñar nuevas estrategias de lucha frente al HIV y otras enfermedades de transmision sexual que no impliquen la realizacion de una intervencion en tan delicada parte.

Referencias
Tomado de:
Sanchez, M. (2010). Curiosidades de la Microbiologia, (on line) url: http://curiosidadesdelamicrobiologia.blogspot.com/2010/01/pellejos-y-microbiota.html cited on Jan 18 de 2010.

martes, 5 de enero de 2010

ARE OUR HOMES MICROBIOLOGICALLY SAFE FOR OUR PETS?


Charles Penn, de la Universidad de Birmingham, dice que tendemos a pensar que nuestros mascotas domésticas son fuente para infecciones en los humanos, pero no lo contrario... Y, mediante diferentes técnicas de biología molecular intenta abrir paso a una camino ahora inexplorado... La microbiología abre nuevos caminos a nuestro entendimiento del mundo y de la realidad.

Ver el artículo completo en: http://www.sgm.ac.uk/pubs/micro_today/pdf/110905.pdf

PENN, C. 2009, Microbiology Today, (on line) url: http://www.sgm.ac.uk/pubs/micro_today/pdf/110905.pdf
(Citado en Enero 5/10)