QUE RELACION EXISTE ENTRE EL CONSUMO DE TABACO Y LA MICROBIOLOGIA

Cuenta Manuel Sanchez, en su Blog "Curiosidades de la MicrobiologIa", que un grupo investigador de la Universidad de Maryland, dirigido por la Dra. Amy Sapkota, se ha puesto a estudiar la fauna microbiologica, o microbiota, presente en los cigarrillos.
Todo el mundo sabe que los fumadores son mas propensos a padecer infecciones respiratorias porque el tabaco debilita las defensas inmunitarias, ademas de otros efectos perniciosos.

Sin embargo, Dra. Sapkota se le ocurrio pensar que los cigarrillos tambien podrian ser una fuente de infeccion, a partir de los microorganismos presentes en ellos.

Cuando se intenta aislar microorganismos de un cigarrillo, mediante el metodo tradicional de conseguir aislamientos en placas de Petri, encuentra una o dos especies de estos. Pero el grupo de Sapkota ha utilizado una aproximacion basada en la genomica: Aislo y secuencio el gen del 16S rRNA de los microorganismos presentes en marcas tan conocidas como Marlboro, Camel o Lucky Strike. Alli encontraron grandes cantidades de bacterias pertenecientes a los generos Campylobacter, que puede causar intoxicaciones alimentarias y el sindrome de Guillain-Barre; Clostridium, que tambien causa intoxicaciones y pneumonias; Corynebacterium, tambien asociada a pneumonias; Escherichia coli, Klebsiella y Pseudomonas, patogenos oportunistas que pueden causar pneumonias, y una gran cantidad de especies de Staphylococcus.

Se podria pensar que el calor generado en la combustion de un cigarrillo seria suficiente para eliminar a las bacterias presentes en el mismo, pero puede que no. La combustion esta en una zona localizada y la aspiracion del humo podria desprender a los microorganismos y transportarlos al interior de los pulmones. Es precisamente este el siguiente objetivo del grupo de la Dra. Sapkota: Demostrar que eso puede suceder.

En conclusion, dejar de fumar es una accion benefica tanto para los pulmones como para el sistema inmune.

*********** The Science of Small Clinical Trials ***********

The Office of Rare Diseases Research at the US National Institutes of Health (NIH), and the Office of Orphan Products Development at the US Food and Drug Administration (FDA), are pleased to announce the 2010 edition of their collaboratively developed course, "The Science of Small Clinical Trials." This is a broad survey course (not a high-level statistical seminar), which is intended to heighten awareness of the methods that exist to design and analyze clinical trials using small numbers of participants. An inescapable necessity when dealing with rare diseases, the use of small trials is also rising in prominence in the context of tissue transplantation, advanced prosthetics, and individualized pharmacogenomics.

The first edition of the course, offered in 2009, was restricted to FDA and NIH staff. The 2010 edition of the course has been revised (based upon comments from 2009 participants), and is now open to ANYONE who wishes to register. The course comprises 7 2-hour lectures, presented at the Lister Hill Center Auditorium on the NIH campus in Bethesda, MD, rom 16 February through 8 March, 2010; the lectures will also be available online via the Internet, live and by delayed on-demand video streaming (using freely available RealPlayer software), allowing anyone with a good Internet connection and appropriate computer to participate (questions from remote attendees will be received via a live text chat room, or via a discussion forum, on a web site dedicated to the course).

ALL participants must register. An optional self-administered open-book, On-line examination will be provided at the end of the course, and individuals who pass this examination will receive a certificate from FDA's Office of Orphan Products Development.

For more information about the course, and online registration, visit: ttp://small-trials.keenminds.org/

R.P.C. Rodgers, MD (CAPT,USPHS)
Office of Orphan Products Development,
FDA 5600 Fishers Lane(HF-35)
Rockville MD 20859
301-827-0142 (Phone)
301-827-0017 (Fax)

Stephen C. Groft, Pharm. D.
Director, Office of Rare Diseases Research,
NIH 6100 Executive Boulevard,
Room 3A-07 Bethesda,
MD 20892-7518
301-435-6041 (Phone)
301-480-9655 (Fax)

Individuals with disabilities who need Sign Language Interpreters and/or reasonable accommodation to participate in this event should contact Chris Griffin, ORDR, (301) 496-0266 and/or the Federal Relay, (1-800-877-8339).

Requests should be made at least 5 days in advance of the event.
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ABOUT  TDR
The Special Programme for Research and Training in Tropical Diseases (TDR) is a global programme of scientific collaboration established in 1975, sponsored by the United Nations Children's Fund, United Nations Development Programme, World Bank and World Health Organization (WHO), and administered by WHO in Geneva, Switzerland. Its focus is on working with institutions in low and middle income countries on research into neglected diseases of the poor, with the goal of improving existing approaches and developing new ways to prevent, diagnose, treat and control these diseases.

For more information, visit: http://www.who.int/tdr

To share news with the TDR community, mailto:tdr-scientists@who.int

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JC Teacher

Microbiologia, tejidos y organos humanos.

Pellejos y Microbiota

Circunsicion de un adulto hallada en las paredes de las tumbas de Ankhmahor, Sakkara (Saqqarah), Egipto. Es la ilustracion mas antigua sobre la circuncision (Fuente: Wikipedia)

El ultimo numero de la revista PLoS ONE publica un curioso articulo titulado: Los efectos de la circuncision en el microbioma del pene. La razon del estudio es la siguiente observacion. Desde hace tiempo se sabe que los hombres circuncidados eran menos susceptibles a la infeccion por VIH o por herpesvirus sexual. En algunos casos el porcentaje de reduccion en infecciones alcanzaba el 40 por ciento. No solo eso, tambien se habia comprobado que las mujeres que mantenian relaciones sexuales con hombres circuncidados sufrian menos vaginosis bacterianas que aquellas que las mantenian con hombres sin circuncidar. ¿Por que sucedia esto?

Antes y despues de la intervencion

Los investigadores han abordado el problema de la siguiente forma. Tomaron muestras de la microbiota del pene de 12 hombres ugandeses negativos para el VIH, antes y despues de someterse a la circuncision. La microbiota fue caracterizada secuenciando el 16S rRNA de los microorganismos presentes. Han encontrado 42 familias bacterianas siendo las mas abundantes la Pseudomonadaceae y la Oxalobacteriaceae, sin importar si el hombre estaba circunciso o no.

Pero si encontraron diferencias en otras familias bacterianas. Los hombres circuncidados presentaban una disminucion en los microorganismos anaerobios. En concreto la Familia XI de los Clostridiales y la Prevotellaceae eran mucho mas abundantes en la microbiota presente antes de la circuncision. Dentro de dichas familias han encontrado generos que incluyen patogenos conocidos por ser causantes de vaginosis bacteriana, como Anaerococcus spp., Finegoldia spp., Peptoniphilus spp., y Prevotella spp. La circuncision elimina el habitat anoxico de dichos microrganismos causando la disminucion en su numero y explicando el menor numero de vaginosis bacterianas en mujeres que mantienen relaciones con dichos hombres.

Patogenos oportunistas presentes en la microbiota del pene sin circuncidar. Las microfotografias no estan a la misma escala. (Fuentes: Prevotella, Anaerococcus, Finegoldia)

Representacion de la abundancia de las familias bacterianas presentes antes (columnas a la derecha) y despues (columnas a la izquierda) de la circuncisi?o en los 12 hombres utilizados en el estudio. Notese que los colores entre las muestras son mas parecidos entre si tras la circuncision. Dicha homogenidad indica que las microbiotas son mas parecidas y que hay una perdida de biodiversidad de la microbiota despues de la intervencion. (Fuente: Price et al. PLoS ONE)

El mecanismo biologico que explicaria la proteccion frente al VIH parece ser multifactorial. Desde el punto de vista anatomico, la superficie interna del prepucio esta muy ligeramente queratinizada y presenta una gran abundancia de celulas de Langerhans, un tipo de celula del sistema inmune especializada en la defensa inespecifica y con capacidad de presentacion de antigeno a los linfocitos CD4. Las celulas de Langerhans son susceptibles de ser infectadas por el VIH y a partir de ellas transmitirse a los linfocitos CD4. En el aspecto microbiologico, las condiciones anoxicas de dicha superficie interna crean un ambiente ideal para el crecimiento de bacterias anaerobias que causan inflamacion de las mucosas y la activacion de las celulas de Langerhans. Al eliminar el prepucio se disminuye el numero de celulas de Langerhans, se queratiniza la zona y se altera la microbiota disminuyendo el numero de microorganismos anaerobios con efectos pro-inflamatorios.

Las celulas de Langerhans en la mucosa del epitelio son probablemente las primeras celulas atacadas por el VIH durante la transmision sexual. Las celulas de Langerhans expresan una lectina de tipo-C denominada Langerina que se une a los viriones del VIH y los conduce hacia el interior formando los granulos de Birbeck. Muchos de los viriones son degradados rapidamente, pero si una fraccion de virus consigue eludir a la degradacion entonces pueden comenzar a replicarse dentro de la celula de Langerhans y desde alli ser transmitidos a los linfocitos T CD4. (Fuente: Nature Medicine)

No es de extrañar que la OMS recomiende la circuncision como una estrategia protectiva, pero hay que tener en cuenta que no es una simple operacion quirurgica, pues en muchas culturas el aspecto del pene tiene un determinado simbolismo. Asi que este descubrimiento puede servir para diseñar nuevas estrategias de lucha frente al HIV y otras enfermedades de transmision sexual que no impliquen la realizacion de una intervencion en tan delicada parte.

Referencias
Tomado de:
Sanchez, M. (2010). Curiosidades de la Microbiologia, (on line) url: http://curiosidadesdelamicrobiologia.blogspot.com/2010/01/pellejos-y-microbiota.html cited on Jan 18 de 2010.

ARE OUR HOMES MICROBIOLOGICALLY SAFE FOR OUR PETS?

Charles Penn, de la Universidad de Birmingham, dice que tendemos a pensar que nuestros mascotas domésticas son fuente para infecciones en los humanos, pero no lo contrario... Y, mediante diferentes técnicas de biología molecular intenta abrir paso a una camino ahora inexplorado... La microbiología abre nuevos caminos a nuestro entendimiento del mundo y de la realidad.

Ver el artículo completo en: http://www.sgm.ac.uk/pubs/micro_today/pdf/110905.pdf

PENN, C. 2009, Microbiology Today, (on line) url: http://www.sgm.ac.uk/pubs/micro_today/pdf/110905.pdf
(Citado en Enero 5/10)

Bioassay report

Bioassay report: "La LDL "mínimamente modificada" (LDLmm) induce en las células endoteliales la expresión de moléculas de adhesión, proteínas quimiotácticas y factores de crecimiento que dan lugar al reclutamiento de monocitos y linfocitos hacia la pared vascular a través de interacciones específicas entre las molécula ...s de adhesión endoteliales y las integrinas de aquéllos.".... Its True!
JC teacher

Como dice el Dr Cann: The origins of cavity-causing bacteria

Bifidobacteria are relatively abundant inhabitants of the gastrointestinal tract of humans and animals. Many bifidobacterial species, in conjunction with other members of the intestinal microbiota are believed to contribute to host nutrition, while also impacting on intestinal pH, cell proliferation and differentiation, development and activity of the immune system, and innate and acquired responses to pathogens. These perceived beneficial health effects have driven commercial exploitation of bifidobacteria as live components of many functional foods and therapeutic adjuncts. However, bifidobacteria have also been isolated from the human oral cavity, where their presence is linked to the progression of tooth decay: bifidobacteria have been detected in high numbers in infected dentine from carious lesions in children and have been associated with childhood dental caries. can be found as part of the microbiota implicated in human dental caries. In recent surveys of oral bifidobacteria associated with caries in adults and children and root caries in adults, Bifidobacterium dentium was the most frequently isolated Bifidobacterium species, representing approximately eight percent of the culturable bacteria isolated from active lesions. This species is capable of acidogenesis to produce a final pH in glucose-containing media below pH 4.2, sufficient to cause extensive demineralisation of tooth tissues. B. dentium may therefore significantly contribute to the pathogenesis of dental caries which is one of the most common chronic diseases, remaining untreated in many underdeveloped countries where dental pain is often alleviated only by the loss or extraction of the affected tooth.



Researchers have now uncovered the complete genetic make-up of the cavity-causing bacterium B. dentium Bd1, revealing the genetic adaptations that allow this microorganism to live and cause decay in the human oral cavity. Bifidobacteria, largely known as long-term beneficial gut bacteria, are often included as probiotic components of food to aid digestion and boost the immune system. However, not all species within the genus Bifidobacterium provide beneficial effects to the host’s health. In fact, B. dentium is an opportunistic pathogen since it has been linked to the development of tooth decay. The genome sequence of B. dentium Bd1 reveals how this microorganism has adapted to the oral environment through specialized nutrient acquisition features, acid tolerance, defences against antimicrobial substances and other gene products that increase fitness and competitiveness within the oral niche. This report identifies, through various genomic approaches, specific adaptations of a Bifidobacterium taxon to a lifestyle as a tooth decay-causing bacterium. The data in this study indicate that the genome of this opportunistic pathogen has evolved through only a small number of horizontal gene acquisition events, highlighting the narrow boundary that separates bacteria that are long-term residents on or in the human body from opportunistic pathogens.



The Bifidobacterium dentium Bd1 Genome Sequence Reflects Its Genetic Adaptation to the Human Oral Cavity. 2009 PLoS Genet 5(12): e1000785. doi:10.1371/journal.pgen.1000785

Bifidobacteria, one of the relatively dominant components of the human intestinal microbiota, are considered one of the key groups of beneficial intestinal bacteria (probiotic bacteria). However, in addition to health-promoting taxa, the genus Bifidobacterium also includes Bifidobacterium dentium, an opportunistic cariogenic pathogen. The genetic basis for the ability of B. dentium to survive in the oral cavity and contribute to caries development is not understood. The genome of B. dentium Bd1, a strain isolated from dental caries, was sequenced to completion to uncover a single circular 2,636,368 base pair chromosome with 2,143 predicted open reading frames. Annotation of the genome sequence revealed multiple ways in which B. dentium has adapted to the oral environment through specialized nutrient acquisition, defences against antimicrobials, and gene products that increase fitness and competitiveness within the oral niche. B. dentium Bd1 was shown to metabolize a wide variety of carbohydrates, consistent with genome-based predictions, while colonization and persistence factors implicated in tissue adhesion, acid tolerance, and the metabolism of human saliva-derived compounds were also identified. Global transcriptome analysis demonstrated that many of the genes encoding these predicted traits are highly expressed under relevant physiological conditions. This is the first report to identify, through various genomic approaches, specific genetic adaptations of a Bifidobacterium taxon, Bifidobacterium dentium Bd1, to a lifestyle as a cariogenic microorganism in the oral cavity. In silico analysis and comparative genomic hybridization experiments clearly reveal a high level of genome conservation among various B. dentium strains. The data indicate that the genome of this opportunistic cariogen has evolved through a very limited number of horizontal gene acquisition events.

Tomado de :
Cann Alan, MicrobiologyBytes, (on line) url: http://www.microbiologybytes.com/blog/2009/12/24/the-origins-of-cavity-causing-bacteria/?utm_source=feedburner&utm_medium=feed&utm_campaign=Feed%3A+Microbiologybytes+%28MicrobiologyBytes%29 (Cited on Dec 24/09)

Microbiologia entomologica y vida en sociedad....

Les comparto un interesante dato publicado por Manolo en su blog "curiosidades de la microbiologia":

JC

Los superpoderes de las cucarachas Hay una vieja historia que dice que en caso de guerra nuclear total, los únicos supervivientes serían las cucarachas. Lo cierto es que uno no puede dudarlo si lee algo sobre lo que son capaces de hacer. El último de sus "superpoderes" ha sido descrito en un reciente artículo publicado en la revista PNAS a cargo de un grupo investigador liderado por la doctora Nancy Moran.
En la escuela aprendemos que el nitrógeno es un gas inerte y que es el principal componente de la atmósfera. Lo de "inerte" tiene su importancia, porque si fuera reactivo como el oxígeno la vida en el planeta sería muy distinta de como la conocemos ahora. El nitrógeno gaseoso (N2) no puede ser usado por casi ninguna célula. Es una molécula tremendamente estable, y es necesario romperla para poder combinar el nitrógeno con otros elementos para así sintetizar proteínas y ácidos nucleicos entre otras biomoléculas.
Son muy pocos los seres vivos que consiguen romper esa molécula de N2, y todos ellos son microorganismos. Son los llamados fijadores del nitrógeno. Quizás el más famosos de ellos sea la bacteria Rhizobium melliloti, que consigue establecer una simbiosis con plantas leguminosas para poder realizar el proceso de fijación. Su simbiosis podría resumirse de la siguiente forma: la planta da cobijo y alimento a la bacteria y ésta a su vez consigue fijar nitrógeno gaseoso en sus compuestos orgánicos, que luego cede a la planta. Una vez ya tenemos el nitrógeno en un compuesto orgánico ya podemos imaginarnos que llega a los animales a través de la dieta: la planta es comida por un herbívoro, y éste a su vez es comido por un carnívoro, etc.
Pero a veces hay problemas con el suministro de nitrógeno orgánico. Así que muchos seres vivos intentan establecer simbiosis con microorganismos que metabolicen eficientemente el nitrógeno y tener un problema alimentario menos del que preocuparse. Y ese truco parece que también lo han aprendido las cucarachas, unos animalitos acostumbrados a alimentarse de cualquier cosa.
Como muchos otros insectos, las cucarachas excretan nitrógeno en forma de ácido úrico, pero con una sutil diferencia. Lo excretan al interior de su cuerpo, en concreto a los llamados cuerpos grasos. De esa forma pueden recuperarlo en caso de necesidad. Pero ¿cómo pueden reciclar ese ácido úrico? Hay dos tipos de células en dichos cuerpos grasos. Uno son adipocitos en los que se acumulan grasas y cristales de ácido úrico. El otro tipo celular consiste en los micetocitos o bacteriocitos, que están llenos de bacterias. En concreto se trata de una bacteria Gram negativa de nombre Blattabacterium y que se transmite de manera vertical entre estos insectos. Células de Blattabacterium en el interior de un micetocito. Las bacterias están señaladas con las flechas blancas. El núcleo del micetocito tiene color azul y están señalados por la flecha blanca punteada (Fuente PNAS).
El grupo investigador ha secuenciado el genoma de la bacteria que se encuentra dentro de la cucaracha Periplaneta americana. Han confirmado que pertenece a las Flavobacterias y que su "pariente más próximo" es el endosimbionte Sulcia muelleri, que vive dentro de insectos especializados en chupar la savia. Mediante la información genómica contenida en sus 636 Mb han reconstruido el posible metabolismo de Blattabacterium y han encontrado que puede reciclar el nitrógeno a partir de urea o de amonio ya que posee genes para la ureasa y la glutamato deshidrogenasa, aunque carece de enzimas uricolíticas. Además es capaz de producir aminoácidos esenciales, varias vitaminas y otros compuestos útiles para la cucaracha. También han concluido que la asociación entre Blattabacterium y las cucarachas se originó hace unos 140 millones de años, en pleno Jurásico.
Predicción del metabolismo de Blattabacterium. En azul se indican las rutas para aminoácidos, en verde la de metabolitos varios y en púrpura la de las vitaminas. En rojo se indican los aminóacidos no producidos por la bacteria y que son originados por la cucaracha(Fuente PNAS).
Como no se han encontrado genes para enzimas uricolíticas en el genoma de Blattabacterium no está muy claro el modo en que aprovechan el ácido úrico. Los investigadores proponen tres hipótesis. La primera es que la actividad uricolítica está producida por otra enzima no identificada en Blattabacterim. La segunda es que la actividad uricolítica sea debida a las células de la cucaracha. Pero en contra de esta hipótesis está el hecho de que si se trata a las cucarachas con antibióticos la actividad uricolítica desaparece. La tercera es que la cucaracha acumule el úrico en los adipocitos y cuando necesita nitrógeno, transporta el úrico al intestino donde la microflora intestinal es capaz de descomponerlo en amonio, que vuelve a ser absorbido y transportado por la hemolinfa a los micetocitos.
Sea lo que sea, hay que reconocer que las cucarachas tienen un kit de supervivencia que sería la envidia de McGyver.

Microbiologia en Accion - Curiosidades...

LIPIDO ASESINO....

Hace unos años se describió que las poblaciones de fitoplakton del Atlántico Norte estaban muriendo en grandes cantidades. Hubo muchas hipótesis que intentaron explicar dicho evento, contaminación, cambio climático, prácticas pesqueras. Pero poco a poco se fue encontrando evidencias de que la responsabilidad recaía en los virus, aunque no se entendía muy bien como podían provocar tal mortandad de manera tan rápida. Ahora, según informa Science Daily, una colaboración entre grupos de la Universidad de Rutgers y la Woods Hole Oceanographic Institution (WHOI) parecen haber encontrado la respuesta al misterio.


(Para continuar la lectura seguir este vìnculo):

http://curiosidadesdelamicrobiologia.blogspot.com/2009/12/lipido-asesino.html

JC

Juan C Gonzalez has shared a presentation on Slideshare

Hi,

Check out this cool presentation on SlideShare:

Title: "Social Media Monitoring & Measurement 09.22.09"
Link: http://www.slideshare.net/kellykearney/ku-masters-presentation-jour-831-technology-in-marketing-communications-092209

Juan C Gonzalez

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Sus exámenes Finales...

Ya están calificados, estaré en el Centro de Computo junto a Rectoría en la mañana, como entre las 10 y 11 a.m. Y luego, en el Centro de IDiomas, Salón B1 - de 1:30 a 5:00 p.m.

Por favor recogerlos para que puedan retroalimentar su proceso....

JC Teacher